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一、产品描述
货号：PRO-S-2-6
英文名：Scaffold ssDNA 7560bp
中文名：7560bp单链DNA支架
品牌：tilibit
规格：800pmol
tilibit Scaffold ssDNA 7560bp 是专为DNA折纸技术（DNA Origami）设计的高纯度单链DNA支架，由德国tilibit Nanosystems GmbH研发。该产品以M13噬菌体单链DNA为骨架，通过精密的分子编程实现自组装，形成用户定义的二维或三维纳米结构。其长度为7560个碱基，具备优异的序列均一性和低错误率（<0.1%），适用于构建分子马达、药物递送载体、生物传感器等复杂纳米器件。
本产品采用超洁净合成工艺，确保无核酸酶残留及宿主基因组污染，并通过紫外分光光度计（A260/A280比值1.8-2.0）和琼脂糖凝胶电泳验证纯度（≥95%）。作为tilibit产品线的核心组件，Scaffold ssDNA 7560bp 支持与短链DNA“订书钉"互补配对，结合镁离子（Mg²⁺）辅助折叠，广泛应用于分子生物学、医疗诊断及材料科学领域。
二、产品特点
1. 高精度与稳定性
tilibit Scaffold ssDNA 7560bp 基于M13噬菌体单链DNA构建，其天然环状结构赋予支架优异的稳定性，可耐受常规实验条件下的温度波动和化学环境。通过化学修饰技术（如氨基基团、荧光染料标记），可精准定位功能基团，支持靶向药物递送和分子识别等应用。例如，在肿瘤诊疗中，氨基修饰的支架可偶联靶向抗体，实现肿瘤标志物的高效捕获。
2. 灵活的设计自由度
借助计算机辅助设计（CAD）软件，用户可自定义纳米结构的形状与功能。支架的7560bp长度允许构建多层级复杂结构，如纳米孔阵列或动态关节。动态设计支持对外部信号（如pH、温度）的响应，例如在酸性环境中触发结构形变，释放负载药物。
3. 严格的质量控制
每批次产品均经过多轮质检，包括：
• 序列验证：通过Sanger测序确认关键区域序列准确性。
• 纯度检测：HPLC分析确保杂质含量低于0.5%。
• 功能测试：折叠效率验证（≥90%）及电泳条带均一性检查。
4. 广泛的应用兼容性
• 科研领域：作为基因编辑模板，支持CRISPR-Cas9系统的精准定位；研究蛋白质-DNA相互作用时，提供高信噪比信号。
• 医疗诊断：构建高灵敏度生物传感器，检测病原体核酸（如新冠病毒）的灵敏度达10 copies/μL。
• 材料科学：开发柔性电子器件，利用DNA支架的导电性设计分子级电路。
三、储存条件
为确保产品性能稳定，需遵循以下储存规范：
• 短期储存：未开封产品于-20℃避光保存，避免反复冻融。
• 长期储存：建议分装为小份（如50pmol/管）后置于-80℃超低温冰箱，可稳定保存12个月以上。
• 使用中储存：已稀释溶液需4℃短期存放（≤7天），避免核酸酶污染。
注意事项：
• 避免接触含EDTA、SDS或高浓度DTT的溶液，以防破坏DNA结构。
• 运输过程中需采用干冰保温，确保温度低于-20℃。
四、工作原理
tilibit Scaffold ssDNA 7560bp 的自组装过程基于DNA折纸技术，具体步骤如下：
1. 支架设计：利用Tiamat或caDNAno等软件设计目标结构的二维/三维模型，生成互补链“订书钉"DNA序列。
2. 折叠反应：将支架DNA与订书钉DNA按比例混合（典型浓度：支架20 nM，订书钉10 nM），加入10×折叠缓冲液（含10-20 mM Mg²⁺）及超纯水，37℃孵育1-2小时。
3. 结构稳定：Mg²⁺通过中和DNA磷酸骨架的负电荷，增强碱基配对特异性，确保结构在生理条件下保持完整。
4. 功能化修饰：通过末端修饰（如生物素、羧基）或点击化学反应引入功能基团，适配下游应用（如抗体偶联、纳米颗粒负载）。
五、解决实验中的关键问题
1. 复杂结构构建难题
传统DNA自组装技术受限于短链DNA的稳定性，难以构建大尺寸结构。本产品通过长链单链DNA支架简化折叠流程，降低设计复杂度。例如，7560bp长度可减少折叠路径中的能量壁垒，提高成功率。
2. 实验效率提升
高纯度单链DNA减少非特异性结合，标准折叠反应仅需2小时（传统方法需6-8小时）。配合预混缓冲液（如Folding Kit Basic），可进一步缩短操作时间。
3. 结构稳定性保障
优化序列设计避免二级结构（如发夹结构），并通过镁离子浓度梯度实验确定条件（推荐10-20 mM），确保结构在PCR扩增或电泳过程中保持完整。
4. 功能化扩展
支持与量子点、金纳米颗粒偶联，开发多模态生物传感系统。例如，在环境监测中，构建对重金属离子响应的荧光DNA纳米探针。
六、使用方法
实验流程：
1. 解冻与稀释
• 4℃解冻后，用超纯水稀释至工作浓度（通常为10-50 nM）。
2. 反应体系配置
• 推荐体积：100 μL
• 成分：
◦ Scaffold ssDNA：20 nM
◦ 短链DNA（订书钉）：10 nM
◦ 10×折叠缓冲液（含Mg²⁺）：1×
◦ 超纯水：补足体积
3. 折叠反应
• 37℃孵育1-2小时，期间可短暂离心去除气泡。
4. 产物纯化
• 使用琼脂糖凝胶电泳分离，切胶回收目标条带（参考凝胶上样染料说明）。
5. 功能验证
• 通过原子力显微镜（AFM）或透射电镜（TEM）观察结构形貌。
注意事项：
• 镁离子浓度需精确控制，过高会导致非特异性结合，过低则影响结构稳定性。
• 长期保存的样品使用前需进行浓度测定（如NanoDrop分光光度计）。
七、常见问题与解决方案
1. 电泳条带模糊或多条带
• 可能原因：DNA降解或污染。
• 解决方案：使用RNase A处理样品，优化纯化步骤（如增加酚-氯仿抽提）。
2. 折叠效率低
• 可能原因：Mg²⁺浓度不足或温度波动。
• 解决方案：补充MgCl₂至终浓度10-20 mM，严格控温（37℃±0.5℃）。
3. 结构形变或断裂
• 可能原因：二级结构干扰或缓冲液离子强度不适宜。
• 解决方案：重新设计序列，避免连续互补碱基；调整缓冲液pH至8.0-8.5。
4. 功能标记失效
• 可能原因：修饰位点被封闭或化学偶联不全。
• 解决方案：选择末端修饰位点（如5'端），优化偶联反应条件（如pH 7.2-7.4）。
关键词：DNA纳米技术、单链DNA支架、分子自组装、DNA折纸结构、纳米生物医学、靶向药物递送、生物传感器开发、基因编辑模板、高纯度ssDNA、动态纳米结构、医疗诊断试剂、材料科学应用、荧光标记DNA、纳米材料合成、DNA损伤修复、防复性ssDNA、抗降解DNA支架、电化学检测、纳米孔测序、定制化纳米器件、M13噬菌体DNA、tilibit，tilibit上海代理，tilibit中国代理，tilibit北京代理，tilibit江苏代理， tilibit广东代理,PRO-S-6-3, p8064-400nM-2ml, PRO-S-2-6, PRO-S-3-8, PRO-S-1-1, PRO-S-2-5, PRO-S-1-2, PRO-S-2-4, PRO-S-3-9, PRO-S-6-2
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货号 | 品名 | 规格 | 品牌 |
PRO-S-6-3 | p7249，2 mL at 400 nM | 800pmol | tilibit |
p8064-400nM-2ml | single-stranded scaffold DNA, type p8064 | 2ml | tilibit |
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PRO-S-1-2 | p7249,2 mL at 100 nM | 200pmol | tilibit |
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PRO-S-3-9 | p8064-100nm-2ml | 200pmol | tilibit |
PRO-S-2-5 | p7560,2 mL at 100 nM | 200pmol | tilibit |
PRO-S-10-21 | p8634,2 mL at 100 nM | 200pmol | tilibit |
PRO-S-6-2 | p7249，2 mL at 100 nM | 200pmol | tilibit |
PRO-S-6-1 | p7249，0.5 mL at 100 nM | 50pmol | tilibit |
PRO-S-2-4 | p7560,0.5 mL at 100 nM | 50pmol | tilibit |
PRO-S-10-22 | p8634,0.5 mL at 100 nM | 50pmol | tilibit |
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PRO-S-3-10 | p8064,2 mL at 400 nM | 800pmol | tilibit |
M1-7 | single-stranded scaffold DNA, type CS4 | 0.5 mL at 400 nM | tilibit |
M1-6 | single-stranded scaffold DNA, type CS3-L | 0.5 mL at 400 nM | tilibit |
PRO-S-10-20 | p8634,2 mL at 400 nM | 800pmol | tilibit |
M1-61-400nM-0.5ml | single-stranded scaffold DNA type CS3-L 0.5 ml at 400 nM | 0.5ml | tilibit |
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M1-6-100nM-0.5ml | single-stranded scaffold DNA, type CS3-L | 0.5ml | tilibit |
Q-2021-1137（定制） | Custom sample M13mp18 single-stranded scaffold DNA, type p7249 2 mL at 1 µM | 1.000 Unit(s) | tilibit |
M1-7-100nM-0.5ml | single-stranded scaffold DNA, type CS4 | 0.5ml | tilibit |
p8064-kit | Folding kit basic, type p8064 | kit | tilibit |
M1-71-400nM-0.5ml | single-stranded scaffold DNA type CS4 0.5 ml at 400 nM | 0.5ml | tilibit |
K1-1-0 | Single-stranded scaffold DNA, type p7249 (M13mp18) 25T p7249-KIT | kit | tilibit |
Q-20251010-111135585 | Cleaved scaffold , 6921 bases, not purified 400 pmol, 1 mL at 400 nM | 1ml | tilibit |
PRO-S-1-3 | p7249,2 mL at 400 nM | 800pmol | tilibit |
p7249-100nM-2mL | single-stranded scaffold DNA, type p7249 | 2ml | tilibit |
M1-61-400nM-2ml | single-stranded scaffold DNA, type CS3-L | 2ml | tilibit |
M1-30-100nM-0.5ml | single-stranded scaffold DNA type p7560 0.5 ml at 100 nM | 0.5ml | tilibit |
K1-3-0 | single-stranded scaffold DNA, type p7560 25T 25 个“标准"（20 nM，100 µl）DNA 折纸折叠反应 | kit | tilibit |
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