▍01 关于 ProtiFi
ProtiFi 是一家致力于将组学技术推向临床应用转化阶段的生物科技公司,长期专注于组学样品制备和处理技术的研究。组学作为一类对生物分子群体进行整体分析的科学手段,涵盖基因组学、转录组学、蛋白质组学、糖组学、代谢组学及脂质组学等重要方向;ProtiFi 围绕这些方向,开发了一系列用于样品收集、制备、流程控制、色谱分析以及数据解析的工具和系统。
在蛋白质组学研究中,样品制备环节往往是导致整体数据变异的关键因素之一。由于蛋白质本身具有多样的溶解特性,且其在收集、存储与处理过程中可能持续发生变化,传统样品处理方法常常面临重复性不足的困扰。ProtiFi 针对这一行业共性难题,构建了以 S-Trap 为核心的技术矩阵,并逐步拓展至多组学样品同步处理、蛋白酶开发以及数据可视化等多个维度,形成了覆盖"样品制备—酶解—数据分析"的完整解决方案。
ProtiFi 的产品已被应用于研究机构和制药企业的日常实验中。数以千计的研究文献引用了 ProtiFi 的样品制备技术,体现出其在组学领域的应用广度。
▍02 核心优势
❶ 通用型样品制备流程
ProtiFi 的 S-Trap 技术采用强变性条件处理样品,提供了一套可通用于各类样品的制备方案。无论是骨组织中的高疏水性蛋白,还是血液中的水溶性蛋白,均可使用同一套流程进行处理,无需针对不同样品类型反复摸索条件。
❷ 重复性与回收率表现稳定
S-Trap 技术在蛋白质鉴定数量、定量重复性方面均有良好表现。相关研究比较了溶液内酶解、FASP 以及 S-Trap 等多种酶解方法,结果表明 S-Trap 在蛋白质鉴定数量和定量重复性上均展现出稳定的性能。
❸ 兼容自动化平台
S-Trap 96 孔板形式可兼容 Tecan A200 正压工作站、安捷伦 Bravo 等多种自动化平台,满足高通量组学样品制备需求。ProtiFi 与 Tecan 合作开发的自动化流程,进一步提升了样品处理的规范程度。
❹ 单样品多组学同步处理
Si-Trap 技术支持从单个样品中同步获取蛋白质、代谢物、脂质、核酸、糖链等多类生物分子的分析组分,为多组学研究提供了统一的样品制备入口。
❺ 酶解时间显著缩短
Tryp-N 作为一种热稳定性酶,可在数分钟至数小时内完成蛋白质酶解,替代传统的过夜酶解步骤,缩短实验周期。
▍03 热门产品介绍
▍产品一:S-Trap 样品制备产品
◎ 产品品名:S-Trap Micro Kit、S-Trap Micro Spin Columns、S-Trap 96-well Micro Plates、S-Trap Turbo 96-well Mini Plates
◎ 产品特点:S-Trap 样品制备产品采用离心柱或 96 孔板形式供应,提供含预制缓冲液的全套试剂盒形式,兼顾操作便利性、最短准备时间与最高重复性。该技术使得在蛋白质组学样品制备中使用 SDS 等强变性剂成为可能,并能去除盐类、去污剂和缓冲液等污染物。其中,S-Trap Turbo 版本进一步缩短了蛋白质组学样品制备的总处理时间;96 孔板版本兼容多种自动化平台。
◎ 存储条件:2-8℃ 保存。
◎ 工作原理:S-Trap 工作流程始于使用强去污剂对样品进行裂解和溶解,继以酸化至 pH 1 以进一步变性蛋白质并消除酶活性,随后使用高浓度有机溶剂处理样品,最后进行酶解反应。整套流程不依赖于样品类型,可从骨组织、血液、脑组织的样品中均可使用同一套流程进行处理。
◎ 使用方法:
1. 使用含强去污剂的裂解缓冲液对样品进行裂解和蛋白溶解;
2. 将样品酸化至 pH 1,进一步变性蛋白质;
3. 加入高浓度有机溶剂,将样品加载至 S-Trap 离心柱或 96 孔板中;
4. 通过离心或正压驱动,使蛋白质被困于 S-Trap 介质中,洗涤去除去污剂、盐类等污染物;
5. 加入蛋白酶进行酶解;
6. 洗脱肽段,用于下游质谱分析。
▍产品二:Si-Trap 多组学样品制备产品
◎ 产品品名:Si-Trap
◎ 产品特点:Si-Trap 在 S-Trap 的基础上进行了优化,专为多组学样品制备而设计。它支持从单个样品中产出多组学分析所需的多个组分。研究表明,使用 MCF7 乳腺癌细胞进行评测时,Si-Trap 在全局蛋白质组、磷酸化蛋白质组和酪氨酸磷酸化蛋白质组分析中识别的蛋白质数量均较尿素法更多;在代谢组学方面,正离子模式下 Si-Trap 检测到 81 种代谢物,与标准工作流程持平,负离子模式下检测到 83 种代谢物,接近标准方法的 85 种。这意味着 Si-Trap 在提供更强的蛋白质组学深度的同时,保留了较广的代谢物检测覆盖度。
◎ 存储条件:具体存储条件请以产品随附说明书为准。
◎ 工作原理:Si-Trap 建立在 S-Trap 技术的高效性基础上,通过对单个样品进行同步处理,分离并捕获蛋白质、代谢物、脂质、核酸、糖链等多类生物分子,使研究人员可以从一次样品制备中获得多组学分析所需的多个组分。
◎ 使用方法:
1. 使用 Si-Trap 专用流程对单个生物样品进行同步处理;
2. 按照流程依次获取蛋白质、代谢物、脂质等组分;
3. 各组分分别进入对应的下游分析流程(如质谱分析等);
4. 整合多组学数据,获得更全面的生物学见解。
▍产品三:Tryp-N 蛋白酶
◎ 产品品名:Tryp-N
◎ 产品特点:Tryp-N 是一种经过工程化改造的热稳定性金属蛋白酶,可对精氨酸和赖氨酸的 N 端进行特异性切割。在单克隆抗体肽图分析中,Tryp-N 表现出与胰蛋白酶相当或更优的序列覆盖率,并提供互补的片段化模式——胰蛋白酶肽段通常具有强烈的 y 离子系列,而 Tryp-N 则产生强烈的 b 离子,这种正交性在确定修饰位点(如脱酰胺、氧化或单氨基酸变异)时尤为有用。研究显示,对于曲妥珠单抗,Tryp-N 实现了重链和轻链 100% 的序列覆盖率;与胰蛋白酶相比,Tryp-N 生成的肽段-谱图匹配数量有所增加(曲妥珠单抗增加 59%、NISTmAb 增加 35%、西妥昔单抗增加 8%、贝伐珠单抗增加 7%)。
◎ 存储条件:具体存储条件请以产品随附说明书为准。
◎ 工作原理:Tryp-N 作为一种热嗜性酶,在数分钟至数小时的时间内即可完成蛋白质消化,而不再需要传统的过夜酶解。它与胰蛋白酶均在 K/R 位点切割,但切割方向相对,从而产生互补的片段化模式,为质谱分析提供正交的证据支持。
◎ 使用方法:
1. 将待酶解的蛋白样品制备好后,加入 Tryp-N 蛋白酶;
2. 在适宜温度下孵育数分钟至数小时;
3. 酶解完成后,获取肽段用于 LC-MS 分析;
4. 如需进一步提高序列覆盖率或修饰位点定位的可信度,可将 Tryp-N 与胰蛋白酶联合使用。
▍04 解决的实验问题
◉ 蛋白质溶解度差异导致的处理难题:蛋白质的溶解特性各异,传统方法难以用流程处理不同类型的样品。S-Trap 使用强去污剂可溶解各类样品(包括整只小鼠心脏在内的组织),并用流程处理骨、血、脑等不同来源样品,从而获得一致的处理结果。
◉ 样品制备变异性过大:据公开研究报道,样品制备环节可能导致蛋白质组学中高达 75% 的整体变异性。ProtiFi 的解决方案将样品制备的数据变异性降低至 10% 以下,提升了数据的可靠性。
◉ 去污剂干扰质谱分析:在制备哺乳动物细胞生物反应器上清液等样品时,培养介质中常含有与质谱蛋白质组学不相容的聚合物表面活性剂(如 Pluronic F68),必须在样品制备过程中清除。S-Trap 可大幅降低或消除此类聚合物,提供洁净的样品。
◉ 多组学研究的样品分割困境:传统多组学工作流需将样品分割或顺序切片,再分别进行处理,既繁琐又可能引入偏差。Si-Trap 允许从单个样品Workflow中获取高质量的代谢组和蛋白质组组分,省去了样品分割的麻烦。
◉ 酶解耗时过长:传统胰蛋白酶酶解通常需要过夜。Tryp-N 将酶解时间缩短至数分钟至数小时,加快了整个蛋白质组学分析的节奏,同时也提升了磷酸肽的回收率。
◉ 单克隆抗体肽图分析的复杂性:在生物类似药可比性、序列确认、多属性方法工作流、翻译后修饰定位以及低水平变异分析中,Tryp-N 可作为胰蛋白酶的"镜像蛋白酶",提供互补的正交证据,有助于在谱图复杂的情况下准确定位修饰位点。
▍05 购买疑问与解答
Q1:ProtiFi 产品通过什么渠道购买?
A:上海起发实验试剂有限公司是 ProtiFi 的特约代理经销商,可通过上海起发实验试剂有限公司采购 ProtiFi 全系产品,包括 S-Trap 系列、Si-Trap、Tryp-N 以及 SimpliFi 数据可视化平台的相关服务。
Q2:S-Trap 产品有哪些规格可选?
A:S-Trap 提供多种规格与形式,包括 S-Trap Micro Kit(适用于 ≤100 µg 样品)、S-Trap Micro Spin Columns、S-Trap 96-well Micro Plates 以及 S-Trap Turbo 96-well Mini Plates,可满足从常规科研到高通量自动化制备的不同需求。
Q3:S-Trap 产品如何保存?
A:S-Trap 通用蛋白质组学样品制备试剂盒的保存条件为 2-8℃。其他产品的具体存储条件请以产品随附说明书为准。
Q4:S-Trap 是否兼容自动化设备?
A:S-Trap 96 孔板形式可兼容 Tecan A200 正压工作站、安捷伦 Bravo 等多种自动化平台。ProtiFi 与 Tecan 合作开发的自动化流程,可实现紧凑型台式样品制备,保证流程的重复性和一致性。
Q5:Tryp-N 与胰蛋白酶有何区别?
A:Tryp-N 和胰蛋白酶均在 K/R 位点切割,但切割方向相对——胰蛋白酶肽段通常具有强烈的 y 离子系列,而 Tryp-N 则产生强烈的 b 离子。这种互补的片段化模式在确定修饰位点(如脱酰胺、氧化或单氨基酸变异)时尤为有用,两者联合使用可进一步提高序列覆盖率。
Q6:Si-Trap 是否真的能从单个样品中获取多组学数据?
A:是的。Si-Trap 支持从单个样品Workflow中产出蛋白质、代谢物、脂质、核酸、糖链等多类生物分子的分析组分。评测数据显示,Si-Trap 在提供更多蛋白质鉴定的同时,代谢物检测覆盖度与标准工作流程相当。
Q7:ProtiFi 产品是否可用于临床诊断?
A:ProtiFi 产品用于科学研究,不可用于人体,不可用于诊断或治疗。
Q8:SimpliFi 数据平台如何使用?
A:SimpliFi 是一个浏览器可访问的在线平台,接受并整合来自任意方法的各类组学数据,将其提炼为干净的交互式展示,并可一键导出。用户无需深厚的组学背景即可探索并可视化数据,理解生物状态并形成假设。
Q9:使用 S-Trap 是否需要改变现有的裂解缓冲液配方?
A:不需要。S-Trap 兼容 SDS、尿素、NP-40、RIPA、SDT 等多种裂解缓冲液,研究人员可延续原有的样品裂解习惯,无需重新建立裂解流程。
Q10:上海起发实验试剂有限公司能提供哪些服务?
A:作为 ProtiFi 特约代理经销商,上海起发实验试剂有限公司可提供 ProtiFi 品牌产品的销售、技术支持与售后服务,协助用户完成产品选型、订购及使用咨询。
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更多产品信息,请联系中国区域代理商:上海起发实验试剂有限公司
(注:本文内容基于品牌公开资料及行业常规信息整理,具体以品牌信息文档为准。)
🔖ProtiFi热卖产品
货号 | 品名 | 规格 |
C02-micro-40 | S-Trap micro columns (≤ 100 μg) | 40pk |
C02-mini-10 | S-Trap™ mini columns (100 - 300 μg) | 10PACK |
K02-micro-10 | S-Trap™ micro kit (10x ≤ 100 μg) | 10pack |
C02-micro-80 | S-Trap™ micro columns (≤ 100 μg) | 80 Pack |
C02-micro-10 | S-Trap™ micro columns (≤ 100 μg) | 10 pack |
K01-20 | Tryp-N™ Kit | 20ug |
C02-mini-80 | S-Trap™ mini columns (100 - 300 μg) | 80 Pack |
C02-midi-10 | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 10pack |
C02-96well-1 | S-Trap™ plate (100 – 300 μg per well) | 1plate |
K02-mini-10 | S-Trap™ mini kit (10x 100 – 300 μg) | 10 pack |
C02-midi-20 | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 20 Pack |
C002-MIDIX-0040PK | S-Trap™ Midi Spin Columns for proteomics samples (≤ 1 mg) | 40PK |
C02-mini-40 | S-Trap™ mini columns (100 - 300 μg) | 40Pack |
96-well S-Trap™ plate | 96-well S-Trap™ plate (100 – 300 μg per well) | 1 plate |
K02-96-1 | Universal proteomics sample preparation kit, 96 well plate (100 µg - 300 µg) with solutions | kit |
K02-micro-160 | S-Trap™ Micro Column sample prep kit format for samples ≤ 100 µg | 160 pack |
P002-96MCR-0001PL | S-Trap™ 96-well Micro Plate | 1plate |
P002-96MNI-0010PL | S-Trap™ 96-well Mini Plate for proteomics samples (100 – 300 µg) | 10plates |
S-Trap™ midi columns | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 10Pack |
K01-10 | Tryp-N™ Kit | 10ug |
CO2-mini-10 | S-Trap™ mini columns (100-300μg) | 10Pack |
C02-Mmidi-10 | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 10pack |
C02-midi-40 | S-Trap™ midi columns (≥ 300 μg) | 40Pack |
C02-96well-3 | 96-well S-Trap™ plate (100 – 300 μg per well) | 3plates |
C02-96-well-3 | S-Trap™ 96-well Mini Plate | 3-Pack |
C002MICRO0080PK | S-Trap™ Micro Spin Columns for proteomics samples (1 – 100 µg) | 80PK |
C002-MIDIX-0020PK | S-Trap™ Midi Spin Columns for proteomics samples (≤ 1 mg) | 20PK |
C002-MIDIX-0010PK | S-Trap™ Midi Spin Columns for proteomics samples (≤ 1 mg) | 10PK |
K02-mini-160 | S-Trap™ Mini Column sample kit format for samples from 100 µg - 300 µg. | 80 Pack |
P002-96MCR-0010PL | S-Trap™ 96-well Micro Plate for proteomics samples (1-100ug) | 10plates |
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